குழந்தைகளுக்கு டயப்பரைப் பயன்படுத்துவது பெற்றோர்களுக்கு வசதியாக இருந்தாலும், அதன் நீண்டகாலப் பயன்பாடு குழந்தையின் ஆரோக்கியத்திற்கு கடுமையான பக்கவிளைவுகளை ஏற்படுத்தலாம். டயப்பரில் பயன்படுத்தப்படும் செயற்கை இழைகள் மற்றும் இரசாயனங்கள் குழந்தையின் உணர்திறன் வாய்ந்த தோலில் ஒவ்வாமையை (அலர்ஜி) உருவாக்கலாம். ஈரமான அல்லது அழுக்கான டயப்பரை நீண்ட நேரம் வைத்திருப்பது பாக்டீரியாக்கள் பெருகுவதற்கான சூழலை உருவாக்கி, டயப்பர் தடிப்புகள் (rash) மற்றும் பல்வேறு தொற்றுகளின் அபாயத்தை கணிசமாக அதிகரிக்கிறது.

சுகாதார வல்லுநர்களின் கூற்றுப்படி, டயப்பரை அடிக்கடி மாற்றுவதும், வீட்டிற்குள் இருக்கும்போது அதன் பயன்பாட்டை முடிந்தவரை குறைப்பதும் அவசியம். தொடர்ந்து டயப்பரைப் பயன்படுத்துவதால், குழந்தைகளுக்கு கழிப்பறை பயிற்சி (Toilet Training) அளிப்பதில் சிக்கல்கள் ஏற்படலாம், ஏனெனில் அவர்கள் டயப்பரிலேயே மலம் மற்றும் சிறுநீர் கழிக்கப் பழக்கப்படுகிறார்கள். மேலும், தரமற்ற டயப்பர்கள் அல்லது இறுக்கமாக அணியப்படும் டயப்பர்கள் தோலில் சிராய்ப்புகளையும் அசௌகரியத்தையும் ஏற்படுத்தலாம். எனவே, டயப்பரைத் தேர்ந்தெடுக்கும்போது அதன் தரம், உறிஞ்சும் திறன் மற்றும் வசதிக்கு முக்கியத்துவம் கொடுக்க வேண்டும்.